1545 में शेर शाह की मौत के बाद हुमायूँ ने वापस आ फिर दीन पनाह को स्थापित किया | हुमायूँ की मृत्यु के बाद अकबर और शाहजहाँ के राज्य में भी आगरा ही मुग़ल सल्तनत की राजधानी बनी रही | लेकिन अंत में शाहजहाँ ने दिल्ली में आकर शाह्जनाबाद की स्थापना की |1638में लाल किला बना जिसके बाद जामा मस्जिद बना और चांदनी चौक इत्यादि बसाये गए |
1739 में नादिर शाह ने दिल्ली पर हमला बोला | उसने बेहद क्रूर रूप से करीब 30000 लोगों का क़त्ल कर दिया |इसके बाद ईस्ट इंडिया कम्पनी ने भारत में प्रवेश किया |
